锦衣卫缇骑四出，到处缉捕人犯，皇帝借着这个机会，进一步清洗朝野，以往那些不好轻易触动的功臣勋贵，这一次全干掉了。（专业提供电子书下载
御史台系统完全瘫痪，大理寺和刑部也挨不上边，所有的案子都是锦衣卫在办理，御史们深感不妥，貌似上书皇帝，说锦衣卫权力过大，恐怕不是好事，皇帝大怒，将这几个御史杖责数百，当场打死在午门。
不过御史们也提醒了皇帝，凡事不能太过倚重某一人，权力必须有制衡才行，于是他下令在紫禁城内成立内务府下辖的辑事厂，专司侦缉审判事宜，办事不需要经过三法司，拥有自己的诏狱和审判系统，这个机构仍由曹少钦掌管，由于地处大内，所以简称为内厂。
曹少钦掌管内厂，锦衣卫提督的位子就空出来了，皇帝将这个重要职位交给于虎的副将文海，以表彰他关键时刻所做出的英勇行为。
原先的御林军被清洗，于虎的嫡系人马全部斩，抄家灭门，确实被胁迫的军士也剥夺军职配甘肃，重新从禁军中选拔三千人充任御林军。
京营禁军这次也是元气大伤，虎贲营整建制撤销，大批京营禁军中高层军官被清洗，北大营的辕门口，每天都有新的人头挂上去，普通士兵也被打散建制重新编排，大批基层军官上位，军队系统大洗牌，原先那些从龙老人全都下去了，或是被拿问治罪，或是被迫请辞，总之军队是不留他们了。
京城血雨腥风，老百姓惶恐不安，官员们也是风声鹤唳，每天都有人在衙署里办着公忽然被内厂的人带走，然后再无音讯，托御史台、刑部的人打听也没用，人家内厂是完全独立的司法机构，别人根本插不进腿。
杀掉数千人，罢免了上百名官员，皇帝的心头才稍微平静了一些，但心头依然有几件事让他不能舒心畅快，第一件是于虎依然在逃，第二件是蓉妃的失踪，第三件是承坤和承平的态度。
于虎随王伴驾二十年，竟然是皇后家族在自己身边偰下的一枚钉子，这个打击让皇帝很不舒服，如果不能将其擒拿归案，以后皇帝的出行都成问题，要知道于虎的箭术天下无双，他若是行刺的话，皇帝就危险了。
第二件事，蓉妃虽然已经是一个废人，但毕竟是皇帝亲自下令软禁的人，就这样明目张胆的借着宫变的风头把人抢走，未免太不把皇帝放在眼里了，更重要的是，蓉妃身上还有一些皇帝不愿意让人知道的秘密。
宫变当日老二和老四的反应让皇帝有些许欣慰，也有些许愠怒，如果不是自己动手还算快的话，现在恐怕已经和玄武门之变的李渊一样，被迫退位成了太上皇了。